Die richtige Dosierung hängt von der jeweiligen Person und dem jeweiligen Einsatzzweck bzw. der vorliegenden Erkrankung ab. Von Experten wird häufig eine tägliche Einnahme um 12mg Lysin pro KG Körpergewicht empfohlen. Dies entspricht z.B. bei einer 80kg schweren Person einer täglichen Dosierung von 960mg L-Lysin pro Tag.
Zur Behandlung von Fieberbläschen und Herpes wird allgemein eine Dosis zwischen 500mg bis 1500mg täglich empfohlen. Einige Quellen empfehlen sogar bis zu 3g Lysin täglich. Generell wird empfohlen die tägliche Dosis in drei Einzeldosen einzunehmen. Bei der Einnahmedauer wird häufig 6 bis 12 Monate empfohlen.
Bei (jüngeren) Kindern wird ausdrücklich empfohlen vor der Verwendung einen Arzt/Therapeuten bezüglich der richtigen Einnahmemenge zu befragen. Eine Konsultation des Arztes sollte ebenfalls erfolgen, wenn eine höhere Einnahmemenge erforderlich erscheint. Bei einem Ausbruch von Genitalherpes ist beispielsweise eine Dosis von bis zu 9g am Tag nicht ungewöhnlich.[2]